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大家好，这里是汉靓的医药科技前沿的第二十期。本周，精准医疗行业有一则新闻广受瞩目：广州基准医疗宣布完成万美金的B轮融资，由通和毓承、思嘉建信基金共同领投，基准医疗的ctDNA甲基化测序技术一直处于行业领先。什么是DNA甲基化测序，该技术如何应用于癌症领域，国内外又有哪些代表性公司？这就是本期想和大家讨论的话题。
本期的话题主要包括以下三个方面：1）DNA甲基化检测定义、方法和应用；以及2）和3）分别介绍国外和国内致力于把DNA甲基化检测应用到癌症领域的领先公司。
第一部分：DNA甲基化检测的定义、方法和在肿瘤领域的应用
DNA甲基化，简单地说，是DNA化学修饰的一种形式，属于表观遗传学，就是在不改变DNA序列的前提下，把甲基添加到DNA分子上，主要形式包括：胞嘧啶环第五号碳原子加入了一个甲基基团。
DNA甲基化为什么和癌症相关？
DNA甲基化后，尽管核苷酸顺序未变，但是可能导致染色体的结构发生改变，有可能通过关闭抑癌基因，从而导致肿瘤发生。
DNA甲基化检测方式包括哪些？
DAN甲基化的检测的方法有十几种，包括甲基化特异性PCR、荧光定量法、基因芯片法等。DNA甲基化测序，是指通过二代基因测序（NGS）的平台对于DNA甲基化进行检测，最常用的步骤是样本先用亚硫酸氢盐处理，将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，然后在NGS的平台上对DNA序列进行分析，从而可以确定哪些碱基是甲基化的。
DNA甲基化检测在癌症领域的具体应用有哪些？
其实和我们之前节目谈到的DNA基因突变检测在肿瘤领域的应用类似，DNA甲基化检测潜在的应用包括癌症的早筛、治疗方案的选择、癌症病情的跟踪等等，检测样本也同样可以来自传统的组织活检或者新型的液体活检。
以上就和大家简单分享了DNA甲基化检测的定义以及其在癌症领域的潜在应用。下面，我们看一下国内外有哪些代表公司致力于该领域。
第二部分：国外致力于把DNA甲基化检测应用到癌症领域的领先公司：Ribomed和MDxHealth
Ribomed是美国加州一家致力于DNA甲基化分子诊断产品开发的生物科技公司。目前已经推出一款同时检测DNA甲基化和基因突变的诊断产品：GliomaSTRAT，主要用于胶质瘤的分级。
该产品检测内容包括以下三个方面：1）通过检测胶质瘤的CpG岛甲基化图谱（检测三个基因的DNA甲基化情况），从而对胶质瘤患者进行分级；2）检测肿瘤的MGMT基因启动子的甲基化情况，从而预测患者是否对于药物替莫唑胺有更好的响应（有研究表明：如果患者MGMT基因的启动子甲基化，对于替莫唑胺的效果会比较好）；3）GliomaSTRAT同时检测患者的肿瘤细胞是否存在IDH基因突变。该诊断产品的DNA甲基化检测采用的方法是qPCR，主要是针对肿瘤组织样本。
我们可以看到Ribomed公司的分子诊断产品通过对于肿瘤DAN甲基化以及基因突变的检测，对胶质瘤患者进行分级，预测替莫唑胺的疗效，从而帮助医生进行后续的治疗。
我们再来看美国的另外一家在DNA甲基化检测处于领先地位的公司：MDxHealth。
今年七月份，MDxHealth宣布推出其基于DNA甲基化和DNA基因变异的分子诊断产品：AssureMDx，用于膀胱癌风险评估。
简单地介绍一下AssureMDx：
在美国，每年有万患者因为尿血去看泌尿科医生。尽管尿血是膀胱癌最常见的一种症状，但是仅有3%-28%的患者最终被确诊为膀胱癌。膀胱癌检测的金标准是膀胱镜检查，但是有创，且费用较高。
MDxHealth公司的分子诊断产品AssureMDx采用液态活检技术，对于患者的尿液同时进行了DNA甲基化和基因突变的检测，从而对尿血患者进行膀胱癌风险评估。其中DNA甲基化检测，是通过甲基化特异性PCR法（MethylationSpecificPCR），检测三个基因（OTX1,ONECUT2andTWIST1）的甲基化情况；DNA的基因突变是采用二代基因测序对另外三个基因（FGFR3,TERTandHRAS）进行检测。
最终的风险评估结果如果显示Positive，则建议患者进行膀胱镜检查，如果显示Negative，医生可以对患者进行持续跟踪。AssureMDx的敏感性达到93%，特异性达到85%，公司认为可以让高达77%的尿血患者免于膀胱镜检查。
从以上两个公司的产品，我们可以看出DNA的甲基化和基因突变检测可以被整合到一款分子诊断产品中，应用领域包括对癌症患者进行癌症分级，指导治疗方案，或者对于高危人群进行癌症风险评判。
最后我们再来看国内该领域的代表企业。
第三部分：国内致力于把DNA甲基化检测应用到癌症领域的领先公司：基准医疗和鹍远基因
我们再回到开头提到的基准医疗。基准医疗目前已经推出了基于ctDNA甲基化高通量测序的肿瘤应用产品：AnchorGPS，通过外周血的cfDNA甲基化高通量测序，帮助鉴别肺部结节的良恶性。
如果AnchorGPS诊断结果显示为恶性，患者有必要进行组织病理活检进行确诊，如果显示为良性，医生可结合其他指标制定后续的诊疗方案。
除了基准医疗，国内另外一家具有领先的DNA甲基化测序技术的公司是鹍远基因，公司的创始人之一的张鹍教授曾在多个学术期刊发表相关的科研文献，指出在多种癌症的治疗过程中，DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。不过公司目前还没有发布基于DNA甲基化测序的检测产品，公司目前推出的基因检测产品还是针对肿瘤基因的突变检测。
从国内国外从事DNA甲基化检测的代表公司，我们可以总结出DNA甲基化检测技术在癌症领域的应用目前还处于比较早期的阶段，走入市场的产品还非常至少，未来如何和DNA基因突变检测结合，如何构建不同癌种的DNA甲基化图谱等都是需要深入研究的问题。
最后总结一下本期的内容，主要和大家分享了DNA甲基化检测在癌症领域的应用，以及国内国外的代表公司，包括基准医疗、鹍远基因、Ribomed和MDxHealth，最后感谢大家的收听/收看，这里是汉靓的医药科技前沿的第二十期，我们下期再见！
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吴汉靓