人体六腑之中的“三焦腑”生理特殊，其胃、胆、大肠、小肠、膀胱等五腑，都是有形有质的腑器，唯独手少阳三焦腑，在上肢上有经脉路线，但在胸腹之内却没有“腑器”的形质。亦类似无形的“十二经脉”结构一样，在人体之内有它的实际功能但没有实体，根据三焦腑的独特生理而综合归纳其认识如下：
1、《灵枢·本脏篇》云：“肾合三焦膀胱，三焦膀胱者，腠理毫毛其应”放手少阳三焦经，虽然在上焦与手心主相协调表里阴阳的运动，但与下焦的肾脏和膀脱还有联络功用。故经云：“少阳属肾，(是指手少阳三焦经而言)肾上连肺”这充分说明手少阳三焦经实隶属于下焦的肾脏，并又牵连着上焦的肺脏，因“肺脏主皮毛”故以上经云：“三焦膀胱者，腠理毫毛其应。”这以上证明，手少阳“三焦经”与“上焦”和“下焦”都有联系，但虽然未言及中焦而中焦亦包括在内，所以称之为“三焦经”。
2、按三焦腑病的症状《灵枢·邪气脏腑病形篇》曰：“三焦病者，腹气满，小腹尤坚，不得小便，窘急、溢则水流为胀，候在足太阳之大络”，放手少阳三焦经的合穴“委阳”与足太阳膀胱经相联系。
3、手少阳三焦经与足厥阴肝经的“上巅顶之脉”和督脉的“百会穴”都有联系。如《灵枢·经别篇》云：“手少阳之正，指天，别于巅，入缺盆，下走三焦。”根据以上对三焦经特别的喻名为“指天”尊称，就足以说明手少阳三焦经在人体施行动用而与其它的五腑大有不同。
4、《素向·灵兰秘典论篇》云：“三焦者，决渎之官，水道出焉。”因肾属北方为“水脏”，与膀既经相表里以施行化气行水利水道，如果没有心火下济于肾，肾脏即缺乏化气行水的蒸腾能量。其三焦经与手心主相表里，主相火，并且其“手少限届肾”，所以手少阳三焦经能使心君之火，向下转移入肾，以协助北方肾脏化气，行水、利水道，因此手少阳三焦经，实是协助肾脏、膀脱之强有力的“化气行水之腑。”
5、由于手少阳三焦经，在人的体内生理功能特别，故而给它以特别的“孤府”之称号。关于这“孤府”的称号认为有两义：
一是其它的五脏、五腑皆有脏、腑配偶，唯独“三焦腑”无正当的配偶之腑，而重配偶干“手心主心包络。
二是三焦腑所施行功用与众不同而称它为“孤府”，因古代的帝王，才称孤道寡，故认为古圣人对“三焦腑”书以“孤府”的称号，是形容“手少阳三焦经”有统率人体周身上、中、下三焦之运输水道的特别功能，因人的生存，全依赖阴、阳、水、火转输以维持生命。按三焦经的病症表现。《灵枢·经脉篇》云：“是动则病手心热，臂肘挛急，腋肿，甚则胸胁支满，心中詹詹大动，面赤，目*，喜笑不休。是主脉所生病者，烦心、心痛，掌中热。